Махайогину Горакхнатхе была особенно дорога жизнь в уединении. Он обнаружил своё собственное присутствие в каждом существе. По милости Матсьендранатхи он достиг состояния кайвальи — пребывания в собственной истинной природе. Он поднялся над хулой и хвалой, все движения его сознания обратились внутрь. Говоря о непосредственном познании Атмана, он утверждал: «Ища вселенную в теле, я обрёл все совершенства. Боги, храмы и священные места — в самом этом теле. Внутри тела я познал неразрушимого Параматмана, Алакх Ниранджана. Крепость тела способен завоевать лишь редкий герой». Вот его слова:
Не прихожу и не ухожу — призываю незапятнанного Натха. Ища вселенную в теле, я обрёл все совершенства. В крепости тела — девять лакхов рвов; У десятых врат, о авадхута, я наложил замок. В крепости тела — бог, храм и Каши; В естественном состоянии встречают Неуничтожимого. Говорит Горакхнатха: слушайте, люди! Лишь редкий сумеет завоевать крепость тела. («Горакх-бани», пад 23.)
Горакхнатха долго совершал подвижничество в Непале, на Гирнаре, у Джвала-Деви и в других местах. В Сатья-югу он практиковал у реки Джелам в Горакх-тилле. В Трета-югу — в Горакхпуре на берегу священной Иравати, или Рапти. Говорят, что там его увидели цари рода Рагху — Рагху, Аджа и Рама — и почли себя благословенными. В Двапара-югу он практиковал в Горакх-мадхи близ Прабхаса-Паттана, в царстве Джунагадх. В Кали-югу место его подвижничества — Горакх-хатти в крепости Пешавара. Ежегодно там собираются бесчисленные почитатели, чтобы выразить ему веру и преданность.
В Непале Горакхнатху почитают как Шиву-Горакшу. Несомненно, своей практикой и подвижничеством он оказал огромное влияние на жизнь народа Непала. Мриг-стхали там служит земным памятником его йогической практики. В Мриг-стхали на Сиддхачале, у реки Багмати в Непале, Горакхнатха совершал суровое подвижничество.
В знаменитом месте силы Патан на границе Непала и Индии Горакхнатха совершал подвижничество, исполняя волю Господа Шивы. Когда после разрушения жертвоприношения Дакши Махадева странствовал с безжизненным телом Сати, покрывало Богини вместе с её левым плечом упало в этом священном месте. Об этом известен стих:
पटेन सहितः स्कन्धः पपात यत्र भूतले । तत्र पाटेश्वरी नाम्ना ख्यातिमाप्ता महेश्वरी ॥ paṭena sahitaḥ skandhaḥ papāta yatra bhūtale । tatra pāṭeśvarī nāmnā khyātim āptā maheśvarī ॥ Где плечо упало на землю вместе с покрывалом, там Махешвари прославилась под именем Патешвари.
Основание обители Патешвари приписывают самому Горакхнатхе. По повелению Господа Шивы он устроил это святилище, поклонялся Богине и практиковал йогу. Надпись 1874 года в Деви-Патане гласит:
महादेवसमाज्ञाप्तः सतीस्कन्धविभूषिताम् । गोरखनाथ योगीन्द्रस्तेन पाटेश्वरीमठम् ॥ mahādevasamājñāptaḥ satīskandhavibhūṣitām । gorakhanātha yogīndras tena pāṭeśvarīmaṭham ॥ По повелению Махадевы владыка йогинов Горакхнатха основал обитель Патешвари, украшенную плечом Сати.
Своим подвижничеством Горакхнатха умножил славу священного Патана. Так по всей Индии чтут многочисленные места, хранящие память о его практике. В Пенджабе, Раджастхане, Саураштре, Карнатаке, Бенгалии, Ассаме, Ориссе, Бихаре, Уттар-Прадеше, Мадхья-Прадеше, во многих областях Уттаранчала и в Непале установлены его священные изображения и изображения пары его стоп, которым поклоняются. Своей йогической практикой и подвижничеством Горакхнатха повлиял на всех — от обитателя хижины до жителя дворца, от нищего до царя.
О том, как махайогин Горакхнатха пришёл от Джвала-Деви в Кангре в Горакхпур и там совершал подвижничество и практиковал йогу, существует почитаемое предание и в натха-сампрадае, и в народе. Однажды Горакхнатха пришёл поклониться Джвала-Деви в Кангре, в Химачал-Прадеше. Богиня предложила ему остаться, но он ответил: «В Вашем святилище приносят тамасическую пищу. Мне здесь нечем будет питаться». Когда она стала настаивать, Горакхнатха сказал: «Хорошо, разведите очаг и поставьте воду греться для кхичри, а я сам принесу зерно с подаянием». Богиня налила в сосуд воду и поставила на огонь. Её очаг горит до сих пор, но Горакхнатха так и не вернулся. Странствуя, он пришёл в Горакхпур, который прославился его именем. Очарованный зеленью и красотой природы, он избрал это место для подвижничества и погрузился в него. Преданные пытались наполнить его чашу для подаяния кхичри, но наполнить её так и не смогли. В память об этом событии каждый год в храме Горакхнатхи на великий праздник Макара-санкранти проходит большая ярмарка кхичри. В храме Горакхнатхи в Горакхпуре установлено величественное изображение махайогина, которому ежедневно и в положенном порядке поклоняются. Храм на земле его подвижничества издавна привлекает натха-йогинов, сиддхов, святых подвижников и простых людей и считается совершенным центром йоги. У берегов вечной священной Рапти, на божественной земле практики Горакхнатхи, этот храм во всём своём величии веками дарит нектар йоги существам, страдающим от трёх видов мучений. В храме явлена личность Горакхнатхи. Во время практики в Трета-югу он зажёг неугасимый огонь. Несмотря на множество бурь и бедствий, тот непрерывно горит в святилище и сегодня. В ту же югу он разжёг неугасимый костёр дхуни, который можно увидеть и ныне. Говорят, его приглашали на празднование коронации Господа Рамы, но он был занят подвижничеством и мог только послать благословение. Другое предание гласит, что герой Пандавов Бхимасена пришёл пригласить его на царское жертвоприношение Юдхиштхиры. Тогда Горакхнатха был погружён в глубокое самадхи, и Бхимасена остановился здесь отдохнуть. Говорят, от тяжести его тела образовался водоём, который можно увидеть во дворе храма. Там же стоит огромное изображение лежащего и отдыхающего Бхимасены. Животворящая сила бессмертной, целостной и исполненной нектара личности махайогина Горакхнатхи — его жизнь подвижника. Он явил йогу как подвижничество и обогатил её правильным поведением, самой жизнью. Своей практикой он вдохнул жизненную силу в чистую натха-йогу, согласную с шиваитскими писаниями о йоге.
Среди многих важных событий жизни махайогина Горакхнатхи — спасение его Гуру Матсьендранатхи от тантрической практики, связанной с чувственными наслаждениями. Он вывел наставника из этой среды, напомнил ему чистый путь сиддхамриты, святую практику натха-йоги и утвердил его в великом знании йоги, преподанном Шивой. Вместо обычая каула-йогини, или каулачары, он напомнил ему учение сиддхов.