Так, в перечне сиддхов Ваджраяны Чарпати стоит пятьдесят девятым, а в тибетской традиции его называют Гуру Минпы. Но в действительности он был учеником самого Горакхнатха. Горакхнатх также был наставником йоги, достигшим совершенства в алхимии. Поэтому естественно, что под его влиянием Чарпатинатх на раннем этапе своей практики увлёкся алхимическим совершенством. Он искал его и хотел победить смерть. Поскольку победить смерть возможно посредством алхимии, он обратился к ней. В изданном в Тарн-Таране сочинении «Пранасангли» приведена беседа Чарпатинатха с Гуру Нанакдевом. Из неё видно, что Чарпатинатх исследовал алхимическое совершенство. Упоминание беседы с Нанаком в «Пранасангли» указывает, что люди его времени занимались алхимией; в древности Чарпатинатх приложил к этому немало труда, поэтому его имя было включено в беседу, чтобы показать значение алхимии. Алхимическое совершенство дарует бессмертие, или божественное тело. В учении натхов обретение такого бессмертия или божественного тела признаётся совершенством тела. В традиции Расешвары это совершенство подробно рассмотрено. Горакхнатх, Нагарджуна, Чарпатинатх и другие были наставниками, достигшими совершенства в алхимии. Чарпатинатх искал совершенства тела посредством алхимических средств. В учении о расе под расой понимают именно ртуть. Существует способ «умерщвления» ртути; он наделяет её удивительной способностью окрашивать, и тогда обработанная ртуть превращает обычный металл в золото. Из ртути также делают шарики расы, или камни расы. Эти камни способны в одно мгновение разорвать покров, который с незапамятных времён сформирован телом вокруг самосветящейся души внутри человека. В учении о расе различные алхимические средства, приготовленные из ртути, питают элементы тела. От этого тело становится крепким, как камень. Телесные сущности сливаются с тонкой сущностью души и превращаются в совершенную телесную сущность. Такое тело называют телом Хары и Гаури, телом пранавы, совершенным телом, телом сиддхи и так далее. Так в поисках устойчивости тела Чарпатинатх исследовал алхимическое совершенство. В разделе о философии Расешвары в «Сарвадаршана-санграхе» упоминается Чарпати (Чарпатинатх). Горакхнатх не придавал устойчивости тела посредством алхимического совершенства такого значения, какое придавал созерцанию души и внутренней йогической практике. Поэтому сиддха Чарпатинатх, не отдавая первенства учению Расешвары, подчёркивал в своей практике размышление о душе. Хотя ртуть и называют соком тела Шивы, а алхимическое средство, образующееся при соединении слюды и ртути, уничтожает смерть и бедность, эти алхимические знания не смогли надолго увлечь Чарпатинатха. Ясно, однако, что он знал алхимию; это отчётливо видно по его шабди.
Бесспорно, в ранней практике йоги Чарпатинатха преобладали алхимические достижения, тогда как в поздней практике широко проявилось совершенство внутренней йоги. В свете знания такого достигшего великого совершенства Гуру, как Горакхнатх, он, согласно принципам учения натхов, принял обращённую внутрь сторону йогической практики.
Освободив практику натхов от внешней пышности, показного поведения и чудес, Чарпатинатх связал её с непосредственным познанием Высшей Души, пребывающей в собственном теле, с совершенством тела и победой над смертью. Он ясно говорил: если практикующий не достигает бессмертия, если, став освобождённым при жизни, он не подчиняет себе смерть, то, тратя время на одни внешние обряды, он никак не обретёт совершенства. Излагая своё понимание йоги, он говорил, что йогин должен наложить мула-бандху, пранаямой очистить от нечистот шестьдесят четыре сустава, обратить старость в молодость и покончить со всеми болезнями. Такова практика йоги. Действовать нужно так, чтобы больше не умирать, чтобы практикующий йогу достиг совершенства тела.
В порядке йогической практики йогирадж Чарпатинатх особо подчёркивал питьё лунного нектара, стекающего из сахасрары. Это особый приём хатха-йоги и естественная ступень к достижению кайвальи в учении Горакхнатха. Он говорил, что посредством вишама-бандхи, или мудры випаритакарани, следует поднять солнце вверх и не дать ему поглотить лунный нектар; луну же у основания нёба надо обратить вниз, чтобы йогин сам выпил нектар, сочащийся из основания тысячелепесткового лотоса в брахмарандхре, и сделал тело бессмертным.
Таким образом, в практике йоги Чарпатинатх подчёркивал очищение тела через асаны, пронизывание шести чакр, упражнения с бандхами и мудрами, а также очищение праны через пранаяму. Благодаря этому прана подчиняется воле, а тело остаётся устойчивым: масло не кончается и светильник не гаснет. Чарпатинатх, не придавая значения внешнему облачению йогина, наполнил смыслом звание «йогин души». Стихотворение, приписываемое Чарпатинатху, содержится в рукописи № 374 библиотеки Пенджабского университета; оно приведено на с. 172 «Натха-сампрадаи». В нём, объявляя учение Чарпатинатха о сиддхах благим, говорится, что йогин должен сосредоточиться на уединённой практике. Ему запрещается носить лохмотья и тому подобное и бродить туда-сюда за подаянием.
В этом стихотворении Чарпатинатх предписывает строго соблюдать долг аскета и даёт добрый совет йогину жить в уединении и предаваться практике. В этом заключается его взгляд на йогу. В одной шабди он говорит, что йогину следует жить под деревом или в горной пещере и усердно заниматься практикой. Поддерживая здоровье тела посредством каякальпы, нужно день и ночь упражняться в йоге.