Есть и другая версия рассказа: на горе Горакхнатх придавил нага Каркотаку, божество дождя, отчего в Непале прекратились дожди и наступила засуха. Царь послал наставника Буддхадатту (Бандхудатту) за Матсьендранатхом. Тот пришёл, и Горакхнатх поднялся из уважения к Гуру. Как только он встал, тучи освободились и пошёл дождь. В память об этом благодеянии Матсьендранатха было учреждено праздничное шествие. Мригстхали в Непале считается священным местом традиции натхов. Рассказывают, что там Горакхнатх по какой-то причине сел, придавив своим сиденьем девяносто шесть крор облачных гряд; дождь прекратился. Царь, посоветовавшись со знатоками писаний, решил привести из Сингхала Матсьендранатха к Горакхнатху в Мригстхали. Шри Горакхнатх не поднялся, а лишь мысленно поклонился ему. От этого движения его левое колено слегка сдвинулось, освободилась одна облачная гряда и пошёл дождь. С тех пор это место стало почитаемой обителью традиции натхов и непальского государства Горкха. В трёх милях от Катманду, на берегу Багмати-Ганги, стоит храм Матсьендранатха. В Бхогапаттане почитают ларец Матсьендранатха. Поскольку Матсьендранатх вошёл в камандалу непальского царя в образе шмеля, его назвали Бхрингпадой.
В честь Матсьендранатха почтенный Нилакантхачарья составил на санскрите в 1733 году эры Викрамы «Матсьендра-падья-шатаку». В ней он с великим почтением припадает к стопам Шри Матсьендры и просит у него благословения для царя Непала. Сочинение содержит сведения о многих непальских правителях, поэтому его вполне можно назвать исторической стихотворной хвалой. Его автор Нилакантха Бхатта пользовался покровительством махараджи Лалитпаттана Шринивасы Маллы. Он был великим учёным и искусно включил в свою сотню стихов непальские сказания о Матсьендранатхе. Там же есть исторические сведения о махарадже Нарендрадеве, который привёз Матсьендранатха в Непал и устроил шествие в его честь. Проникновенны слова ачарьи Нилакантхи:
«О Матсьендра! Лунный свет ногтей твоих лотосных стоп сияет отблеском самоцветов в светлых венцах богов, склоняющихся перед тобой. Ни мы, ни даже Шеша не в силах описать рождённую им красоту».
Сострадание Матсьендранатха не нуждается в причине: он одинаково милостив к людям всех религий и последователям разных духовных путей.
«О Матсьендранатх! Одни почитают тебя, следуя буддийскому пути, другие — ведийскому, третьи — шиваитскому, шактистскому, солнечному, пути Ганапати и другим. О Боже, ты благосклонен ко всем им».
Во всём Непале Матсьендранатх окружён несравненным почётом. Заслуга избавления страны от страшной двенадцатилетней засухи живительным дождём навсегда останется вписанной золотыми буквами в историю Непала. Жизнь владыки йогинов Матсьендранатха совершенно священна и преисполнена великой милости.
Непальский царь Нарендрадева устроил шествие в память о том, как Матсьендранатх пришёл из священной обители Камарупы и избавил Непал от засухи. Праздниками колесничного шествия и великого омовения он сделал священную память о Матсьендранатхе культурным достоянием непальского народа. В Непале известна поговорка: во всей вселенной нет шествия, равного шествию Матсьендранатха.
Царь Нарендрадева велел чеканить имя Матсьендранатха на государственной монете как имя покровителя страны. Монеты с его именем ещё встречаются в Непале. На них выбиты надписи: «Шри Шри Локанатхая», «Шри Шри Локанатх» и «Шри Шри Карунамая».
Владыка йогинов Матсьендранатх достоин высшего почитания не только в Непале и Индии, но и во всём мире. Его знание йоги, великое знание, служит благу мира. Его философия йоги, учение пути нектара совершенства, обращена ко всему человечеству и имеет всеобщее значение.
Слова Шри Матсьендранатха не расходились с делами. О его философских принципах, практике и знании йоги можно сказать следующее. В начале своей практики он оживил представления шиваитского пути йоги размышлением каула, соединил йогу с тантрическим почитанием шакти и развил учение йогини-каула. Его «Каула-джняна-нирная» — изложение принципов этого учения. Впоследствии благодаря добрым усилиям Шри Горакхнатха он принял великое знание — шиваитское учение о йоге, знание шестичастной йоги, — вдохнул жизнь в учение сиддхов, путь нектара совершенства, или традицию натхов, и укрепил преемственность натха-йоги. Согласно «Каула-джняна-нирнае», Шри Матсьендранатх — первый провозвестник принципов знания каула. Его называют открывшим все писания кула; под ними подразумевается знание каула. Из четырнадцатой главы «Каула-джняна-нирнаи» видно, что Бхайрава (Шива) говорит о созерцании, для которого не требуются ни мантра, ни пранаяма, ни созерцание чакр. Такое преподанное Шивой созерцание и без них дарует высшее совершенство.
Приведённый отрывок освещает четыре воплощения Шивы в четырёх югах. Говорится: пусть все с преданностью услышат, что после махакаулы явился сиддха-каула, а после него — Масадар (Матсьодара-Матсьендра). В первую, Сатья-югу, установленное Шивой знание называлось знанием каула; во вторую, Трета-югу, — сиддха-каулой; в третью, Двапара-югу, — сиддхамритой, а в четвёртую, Кали-югу, — Матсьодарой. Знание, исходящее от Матсьодары, и зовётся знанием йогини-каула. Прежде чем следовать пути йогини-каула, Матсьендранатх развивал учение сиддха-каула. Именно оно признаётся традицией натхов. Бесспорно, высшая цель пути йоги традиции Горакши и установленного Матсьендрой пути каула едина. Различие в том, что йогин с самого начала приступает к внутреннему почитанию, а последователь учения каула, тантрик, после внешнего почитания постепенно обращается к внутренней практике — пробуждению кундалини.