Второй лотос, находящийся у основания лингама, называется Свадхистхана. Он ярко сияющий, багряного цвета, шестилепестковый — ब, भ, म, य, र, ल — это шесть слогов Матрики. Каждый лепесток исполнен одной из шести наклонностей: пренебрежение, помрачение (обморок), потворство, недоверие, погибель и жестокость. Внутри его сердцевины пребывает белая мандала Варуны (Воды) в форме полумесяца. В её середине — белая биджа Варуны, Вам. В её центре, олицетворяя биджу Варуны, восседает на макаре белый двурукий бог Варуна. На коленях у него восседает Хари, хранитель мира, исполненный юной свежести. У Него четыре руки, в которых Он держит раковину, диск, палицу и лотос. На груди Его сияют знак Шриватса и камень Каустубха, а облачён Он в жёлтые одежды. На коленях у Него восседает Его Шакти по имени Ракини, облачённая в божественные одежды и украшения, четырёхрукая, светлого цвета.
Медитируя на этот лотос, обретают преданность (бхакти), здоровье, владычество и прочие совершенства.